Βασικός στόχος του Προγράμματος ήταν η αξιολόγηση του κινδύνου από τα φυτοφάρμακα και η ενημέρωση:

1.      των Κυπρίων καταναλωτών για τους κινδύνους που πιθανόν να διατρέχουν από την κατανάλωση φρέσκων φρούτων και λαχανικών στα οποία έχουν χρησιμοποιηθεί ένα ή περισσότερα φυτοφάρμακα (διατροφική έκθεση).

2.      των γεωργών και εργατών που ασχολούνται στο γεωργικό τομέα για τους κινδύνους που πιθανόν να διατρέχουν κατά τη χρήση διαφόρων φυτοφαρμάκων ή κατά τη διάρκεια διεξαγωγής εργασίας σε χώρους που έχουν χρησιμοποιηθεί φυτοφάρμακα (επαγγελματική έκθεση) και

3.      των οικογενειών που πιθανόν να εκτίθενται στα φυτοφάρμακα που χρησιμοποιούνται γύρω από το σπίτι (οικιστική έκθεση).

Επιπρόσθετος στόχος του Προγράμματος ήταν να τεθούν οι βάσεις για μελλοντικές αξιολογήσεις του κινδύνου. Τα στοιχεία Επικινδυνότητας (τοξικολογικά στοιχεία) που έχουν χρησιμοποιηθεί κατά την αξιολόγηση του Κινδύνου (Κίνδυνος = Επικινδυνότητα x Έκθεση) είναι παρμένα από διεθνείς υπηρεσίες (United States Environmental Protection Agency) ενώ τα στοιχεία Έκθεσης (Έκθεση = ποσότητα κατανάλωσης τροφίμων x ποσότητα υπολειμμάτων στα τρόφιμα) έχουν ληφθεί από μελέτες που έγιναν εξ΄ ολοκλήρου κάτω από Κυπριακές συνθήκες στα πλαίσια του παρόντος προγράμματος